一、信贷授权管理
建立贷款质量考评机制和贷款授权机制，依据基层农村信用社内、外部环境确定其年度信贷授权额度。内部环境主要包括农村信用社整体管理水平，以往年度、特别是上年度已发放贷款的风险程度等；外部环境主要包括农村信用社所在地的经济发展水平、信用环境和经营状况、联社当年的贷款投向、投量计划等。贷款授权经营后，要严格落实信贷管理制度，加大新放贷款的检查力度和频率，严防操作风险和道德风险，发现违规违纪行为，严肃处理。
        二、费用开支限额管理
对农村信用社的费用管理实行“核定标准、包干使用、定期报账”的方法。对农村信用社限额的开支项目，农村信用社和联社要分别设立台帐，设专人逐笔登记，定期核对，稽核部门定期检查，防止农村信用社限额内的开支一报到顶，但实际没有开支，而是流入个人腰包，形成案件。同时，对开支控制较好或节余的社，联社应适当给予精神和物质鼓励。
        三、薪酬管理
根据存款、股本金、清非、收息、中间业务收入等实现情况通过不同的计价标准确定绩效工资，按季打包到社。对农村信用社的二次分配情况，联社要加强检查，坚决杜绝平均主义，以免影响基层社职工的积极性。检查的重点是农村信用社对每名员工工作量完成情况所记载的台帐是否完整准确、农村信用社是否按每个职工的工作业绩兑现了个人绩效工资。